Kasutage seda individuaalset suguluskoefitsiendi kalkulaatorit, et hinnata geneetilist mitmekesisust loomaanalüüsi arvu põhjal. See tööriist aitab hinnata heterosügootsete markerite osakaalu geneetilises profiilis ja seda saab kasutada indikaatorina koerte, kasside ja hobuste sugulusaretuse ülevaatamisel.
Saadaolevate SNP andmete põhjal heterosügootsete autosomaalsete markerite protsendi arvutamiseks sisestage allpool olev analüüsinumber.
Arvutage individuaalne suguluskoefitsient
Mida tähendab sugulusaretus?
Inbreeding viitab kahe erineva alleeli olemasolule geneetilisel markeril. Populatsioonigeneetikas ja aretusanalüüsis seostatakse heterosügootsete markerite suuremat osakaalu üldiselt suurema geneetilise mitmekesisusega, samas kui väiksem osakaal võib kajastada suurenenud sugulust.
See kalkulaator vaatab läbi sobivad autosomaalsed SNP-markerid ja mõõdab, kui paljud neist on heterosügootsed. Tulemust näidatakse tõlgendamise hõlbustamiseks nii suhtarvuna kui ka protsendina.
Kuidas kalkulaator töötab
- Arvesse võetakse ainult autosoomseid SNP markereid.
- Suguga seotud markerid, nagu X, Y ja Amelogenin, on välistatud.
- Kaasatud on ainult kehtivad genotüübid kujul A/A, A/T, A/G, A/C, T/T, T/G, T/C, G/G, G/C, C/C.
- Lõpptulemus näitab heterosügootsete markerite arvu jagatud loendatud markerite koguarvuga.
Kuidas tulemust tõlgendada
Selle tööriista kuvatav protsent näitab valitud looma markeritaseme heterosügootsust. See võib olla kasulik üksikisikute võrdlemisel või geneetilise mitmekesisuse ülevaatamisel, kuid seda tuleks tõlgendada koos põlvnemisteabe, aretuseesmärkide ja vajaduse korral haiguse riskianalüüsiga.
Aretusotsuste puhul võib see individuaalne tulemus täiendada laiemat ülevaadet suguluskoefitsiendi tööriistad, geneetilise pärandi ennustamine ja teie tõu spetsiifiline geneetiline kontekst.
Korduma kippuvad küsimused
Mida see kalkulaator mõõdab?
See tööriist mõõdab heterosügootsete autosomaalsete SNP markerite osakaalu ühe looma saadaolevas geneetilises profiilis ning väljendab tulemust suhte ja protsendina.
Kas heterosügootsus on sama mis suguluskoefitsient?
Mitte täpselt. Heterosügootsus on markeripõhine geneetilise variatsiooni mõõt, samas kui suguluskoefitsient on tõenäosuspõhine hinnang sugulusele või identiteedile põlvnemise järgi. Need on seotud mõisted, kuid need ei ole omavahel asendatavad.
Kas ma saan seda tööriista kasutada koerte, kasside ja hobuste jaoks?
Jah. Seda kalkulaatorit saab kasutada, kui koerte, kasside ja hobuste kohta on saadaval ühilduvad SNP andmed.
Miks on mõned markerid arvutusest välja jäetud?
Suguga seotud markerid ja kehtetud või mittetäielikud genotüübid on välistatud, et hoida arvutus keskendunud ainult kehtivatele autosomaalsetele SNP-markeritele.
Mis on suguluskoefitsient (suguluskoefitsient)?
Suguluskoefitsient hindab, kui geneetiliselt sarnased on looma vanemad. Koerte, kasside ja hobuste puhul peegeldab kõrgem suguluskoefitsient üldiselt väiksemat geneetilist mitmekesisust, samas kui madalam suguluskoefitsient näitab tavaliselt suuremat mitmekesisust.
Miks on suguluskoefitsient oluline?
suguluskoefitsient aitab aretajatel ja omanikel paremini mõista geneetilist mitmekesisust. See võib olla kasulik paarituste planeerimisel, aretusprogrammide jälgimisel ja päriliku riski tõlgendamisel populatsiooni mitmekesisuse laiemas kontekstis.
Põlvnemispaarituse koefitsient vs genoomse suguluskoefitsient
Põlvnemispõhine suguluskoefitsient arvutatakse registreeritud esivanemate põhjal. Genoomne suguluskoefitsient arvutatakse otse DNA andmete põhjal. Genoomne suguluskoefitsient võib anda otsesema ülevaate tegelikust geneetilisest sarnasusest, kuna see mõõdab looma genoomis täheldatud variatsioone.
Kuidas me seda arvutame
Meie analüüsis kasutatakse sugulusaretuse ja geneetilise mitmekesisuse hindamiseks valideeritud SNP markereid kogu genoomis. See SNP-põhine lähenemine on loodud pakkuma kindlat genoomi hinnangut, mitte tuginema ainult sugupuu kirjetele.
Markeri kvaliteet ja standardid
Kasutame laboratoorselt kinnitatud DNA markereid ja kvaliteedikontrolliga genotüpiseerimise meetodeid. Kui see on asjakohane, on meie töövood kooskõlas tunnustatud geneetiliste testimise standarditega, sealhulgas ISAG-iga ühilduvate lähenemisviisidega markerite kvaliteedi, genotüpiseerimise usaldusväärsuse ja tõlgendamise osas.
Oluline tõlgendusmärkus
suguluskoefitsient on hindamisvahend ja seda ei tohiks tõlgendada eraldi. Tulemust tuleks arvesse võtta koos tõu konteksti, põlvnemisteabe, kui see on saadaval, tervisekontrolli tulemuste ja aretuseesmärkidega.